Il museo espone reperti ritrovati nei siti antichi, situati nel territorio urbano ed extraurbano di Caltanissetta, databili dalla preistoria all’epoca romana. Tra i siti più importanti, Dessueri, nel territorio di Mazzarino, presenta i resti di un complesso abitativo risalente all’età del bronzo (XI-X sec. a. C.) con una vasta necropoli. Presso Mussomeli si trovano i resti di un villaggio indigeno e di una necropoli (IX-VII sec. a. C.). Altri siti sono quello di Gibil Gabib e Sabucina, nel territorio di Caltanissetta, e quello di Vassallaggi.